MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanobacterium sp. AL-21 chromosome

Total Repeats: 12360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015216	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015216	TTAA	2	8	43	50	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015216	T	7	7	1420	1426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015216	CCA	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015216	CTA	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015216	T	10	10	1474	1483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015216	T	6	6	1490	1495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015216	T	6	6	1519	1524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015216	A	6	6	1533	1538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015216	ATTT	2	8	1564	1571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015216	T	6	6	1569	1574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015216	ATTT	2	8	1579	1586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015216	T	10	10	2552	2561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015216	AT	3	6	2565	2570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015216	A	6	6	3015	3020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015216	TAT	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015216	TAT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015216	TCC	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015216	CGATT	2	10	4358	4367	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015216	ATTG	2	8	4380	4387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015216	TAA	2	6	4448	4453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015216	AAT	2	6	4465	4470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015216	A	7	7	4517	4523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015216	T	7	7	4528	4534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015216	ATT	2	6	4935	4940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015216	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015216	A	6	6	4968	4973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015216	ATC	2	6	4988	4993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015216	TTA	2	6	5019	5024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015216	ATA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015216	GAA	2	6	6353	6358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015216	AT	3	6	8811	8816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015216	A	7	7	8831	8837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015216	ATTTAA	2	12	9014	9025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015216	AT	3	6	9067	9072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015216	ATTC	2	8	9078	9085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015216	ATTTG	2	10	10386	10395	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015216	AAC	2	6	10415	10420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015216	TTA	2	6	10468	10473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015216	AAT	2	6	10474	10479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015216	TG	3	6	10486	10491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015216	TAAAAA	2	12	10509	10520	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015216	A	8	8	10516	10523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015216	AC	3	6	11953	11958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015216	A	9	9	11976	11984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015216	ATAA	2	8	11991	11998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015216	A	7	7	11997	12003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015216	AAT	2	6	14055	14060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015216	GAA	2	6	14066	14071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015216	AGG	2	6	14139	14144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015216	TAAAAA	2	12	15822	15833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015216	A	8	8	15829	15836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015216	ATC	2	6	18732	18737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015216	ATT	2	6	18790	18795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015216	TGAAT	2	10	18826	18835	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015216	CAA	2	6	18855	18860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015216	ATA	2	6	18861	18866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015216	ATTC	2	8	20083	20090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015216	ACTA	2	8	20185	20192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015216	TAC	2	6	20203	20208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015216	GGA	2	6	20242	20247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015216	T	9	9	21273	21281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015216	A	7	7	21284	21290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015216	ATTTT	2	10	21684	21693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015216	AGT	2	6	22146	22151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015216	TAA	2	6	22815	22820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015216	GTT	2	6	22833	22838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015216	AAC	2	6	22913	22918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015216	TAT	2	6	22999	23004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015216	AAGG	2	8	23005	23012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015216	TAT	2	6	24214	24219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015216	ATA	2	6	24225	24230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015216	A	6	6	24237	24242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015216	GTA	2	6	24243	24248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015216	TTG	2	6	24697	24702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015216	AT	3	6	24710	24715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015216	T	6	6	24807	24812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015216	TGTT	2	8	24973	24980	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015216	T	8	8	25018	25025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015216	TTC	2	6	25071	25076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015216	AT	3	6	25124	25129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015216	TAAT	2	8	25141	25148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015216	TA	3	6	25875	25880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015216	ATA	2	6	26260	26265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015216	A	6	6	26268	26273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015216	T	7	7	26304	26310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015216	T	7	7	26331	26337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015216	T	6	6	26361	26366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015216	TAAA	2	8	26382	26389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015216	GAG	2	6	26397	26402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015216	TAA	2	6	26404	26409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015216	T	6	6	26421	26426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015216	ACT	2	6	26492	26497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015216	ATT	2	6	26540	26545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015216	TCC	2	6	26568	26573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015216	A	6	6	26602	26607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015216	GAA	2	6	26611	26616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015216	AAAAT	2	10	26678	26687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015216	TAT	2	6	26708	26713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015216	TTA	2	6	26714	26719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015216	TAAAA	2	10	26723	26732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015216	AT	3	6	26747	26752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015216	AAT	2	6	26818	26823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015216	A	8	8	27509	27516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015216	GAG	2	6	27545	27550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015216	AGG	2	6	27580	27585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015216	ATA	2	6	27984	27989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015216	A	6	6	29288	29293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015216	TAA	2	6	29352	29357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015216	ATT	2	6	29400	29405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015216	GAAA	2	8	29412	29419	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015216	AAT	2	6	29444	29449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015216	TCC	2	6	29707	29712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015216	T	8	8	29733	29740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015216	TA	3	6	29754	29759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015216	ATT	3	9	29803	29811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015216	ATA	2	6	29832	29837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015216	TCC	2	6	31641	31646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015216	AT	3	6	31667	31672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015216	CAT	2	6	31685	31690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015216	TTA	2	6	31699	31704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015216	AG	4	8	31721	31728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015216	A	6	6	31756	31761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015216	ATT	2	6	31795	31800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015216	AAT	2	6	31808	31813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015216	CAC	2	6	31846	31851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015216	ATTAG	2	10	31862	31871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015216	ACT	2	6	32605	32610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015216	AGTT	2	8	32619	32626	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015216	A	6	6	33811	33816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015216	TA	3	6	33880	33885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015216	A	8	8	33913	33920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015216	TAT	2	6	33934	33939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015216	T	7	7	34986	34992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015216	TAA	2	6	35623	35628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015216	TAT	2	6	35629	35634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015216	TTA	2	6	35658	35663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015216	ATT	2	6	37090	37095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015216	ATA	2	6	37551	37556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015216	ACG	2	6	37558	37563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015216	ATC	2	6	37586	37591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015216	TAA	2	6	37627	37632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015216	TATT	2	8	37661	37668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015216	TAAA	2	8	38361	38368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015216	T	6	6	38432	38437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015216	A	10	10	38448	38457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015216	ATT	2	6	40290	40295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015216	TATT	2	8	40304	40311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015216	T	6	6	40310	40315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015216	AAT	2	6	40340	40345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015216	CGA	2	6	40389	40394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015216	ATT	3	9	40425	40433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015216	CAA	2	6	40487	40492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_015216	TG	3	6	40673	40678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015216	TTA	2	6	40688	40693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015216	ATA	2	6	40695	40700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015216	CAT	2	6	40716	40721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_015216	T	9	9	42332	42340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015216	A	7	7	42347	42353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015216	TAAA	2	8	42361	42368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015216	GTA	2	6	42411	42416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015216	ATTG	2	8	42855	42862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015216	T	9	9	43577	43585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015216	TAT	2	6	45101	45106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015216	ATTG	2	8	45128	45135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015216	ACT	2	6	46435	46440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_015216	A	8	8	46648	46655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015216	TAAT	2	8	48058	48065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015216	TTTAA	2	10	48100	48109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_015216	T	6	6	48120	48125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015216	ATT	2	6	48998	49003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015216	TTG	2	6	49028	49033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_015216	T	9	9	51979	51987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015216	TAA	2	6	52066	52071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_015216	CAA	2	6	53281	53286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_015216	A	7	7	72066	72072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_015216	TAA	2	6	113450	113455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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